| 種名 | 産地 | |
|---|---|---|
| 1 | Anabaena affinis | 北海道札幌市の山口湖、茨城県霞ヶ浦、滋賀県琵琶湖 |
| 2 | Anabaena akankoensis | 北海道阿寒湖 |
| 3 | Anabaena aphanizomenoides | 千葉県印旛沼、福井県三方湖、島根県穴道湖 |
| 4 | Anabaena circinalis | 北海道阿寒湖、本州中部 |
| 5 | Anabaena citrispora | 北海道渡島大沼 |
| 6 | Anabaena crassa | 北海道阿寒湖、茨城県霞ヶ浦、長野県沓沢湖 |
| 7 | Anabaena curva | 青森市内の池 |
| 8 | Anabaena cf. elliptica | 長野県白樺湖 |
| 9 | Anabena eucompacta | 千葉県八鶴湖 |
| 10 | Anabaena flos-aquae | 茨城県霞ヶ浦、長野県諏訪湖 |
| 11 | Anabaena cf. heterospora | 北海道稚内のシュプントー、栃木県渡良瀬遊水地 |
| 12 | Anabaena kisseleviana | 茨城県霞ヶ浦 |
| 13 | Anabaena lemmermannii | 北海道阿寒湖 |
| 14 | Anabaena levanderi | 福井県水月湖 |
| 15 | Anabaena macrospora | 長野県木崎湖 |
| 16 | Anabaena mendotae | 北海道阿寒湖、その他の北海道の湖沼、神奈川県相模湖 |
| 17 | Anabaena minispora | 千葉県印旛沼 |
| 18 | Anabaena mucosa | 北海道利尻島の姫沼、塘路湖、青森県津軽十二湖、神奈川県相模湖、津久井湖 |
| 19 | Anabaena oumiana | 千葉県印旛沼、滋賀県琵琶湖 |
| 20 | Anabaena planctonica | 北海道上幌延の堰止湖、阿寒湖、渡島大沼、茨城県霞ヶ浦、山梨県河口湖 |
| 21 | Anabaena pseudocompacta | 茨城県霞ヶ浦、千葉県手賀沼、印旛沼 |
| 22 | Anabaena reniformis | 兵庫県志方二子池、昆陽池 |
| 23 | Anabaena smithii | 北海道と東北地方の湖沼に広く分布。本州中部 |
| 24 | Anabaena cf. solitaria | 釧路湿原シラルトロ川沿いの浅い沼 |
| 25 | Anabaena spiroides | 三島池 |
| 26 | Anabaena tenericaulis | 皇居の堀千鳥ヶ淵 |
| 27 | Anabaena tsugaruensis | 青森県津軽十二湖の日暮の池 |
| 28 | Anabaena ucrainica | 千葉県印旛沼、神奈川県相模湖、滋賀県琵琶湖 |
| 29 | Anabaena viguieri | 北海道サロベツの兜沼、江別市大麻団地の池、千葉県印旛沼 |
| 30 | Anabaenopsis arnoldii | 千葉県浦安の養魚池、本州中部 |
| 31 | Anabaenopsis circularis | 千葉県印旛沼 |
| 32 | Aphanizomenon flos-aquae var. flos-aquae | 北海道札幌市の茨戸湖 |
| 33 | Aphanizomenon flos-aquae var.klebahnii | 北海道渡島大沼、茨城県霞ヶ浦 |
| 34 | Aphanizomenon issatschenkoi | 茨城県霞ヶ浦、北海道天塩川の河堰湖 |
| 35 | Aphanizomenon paraflexuosum | 北海道サロベツ湿原の沼 |
| 36 | Aphanizomenon yezoense | 礼文島久種湖 |
| 37 | Arthrospira maxima | 千葉県手賀沼、兵庫県昆陽池 |
| 38 | Cylindrospermopsis curvispora | 愛知県名古屋市牧野ヶ池 |
| 39 | Cylindrospermopsis raciborskii | 茨城県神栖町の神之池 |
| 40 | Gloeotrichia echinulata | 長野県居谷里、兵庫県明石市皿池 |
| 41 | Microcystis aeruginosa | 東京都奥多摩湖、小笠原時雨ダム、千葉県手賀沼、長野県白樺湖、沓沢湖、石川県能登一宮、島根県古志池、愛媛県登尾池。以上のほか、霞ヶ浦、諏訪湖においても本種はしばしば優占種となる |
| 42 | Microcystis firma | 茨城県霞ヶ浦、千葉県印旛沼、手賀沼、神奈川県相模湖、津久井湖 |
| 43 | Microcystis ichthyoblabe | 北海道茨戸湖、渡島大沼、長野県諏訪湖、新池、神沢池、六助池、鳥取県湖山池、島根県浮布池、愛媛県登尾池、福岡県太宰府の池、八女昭和池。以上のほか霞ヶ浦でも多量に発生することがある |
| 44 | Microcystis novacekii | 北海道渡島大沼、茨城県霞ヶ浦、長野県六助池、千鹿頭池、滋賀県余呉湖、以上のほか諏訪湖にも出現する |
| 45 | Microcystis viridis | 北海道茨戸湖、茨城県霞ヶ浦、千葉県手賀沼、長野県諏訪湖、千鹿頭池、福井県三方湖、福岡県昭和池 |
| 46 | Microcystis wesenbergii | 北海道茨戸湖、大沼湖、山形県鶴岡公園の掘、茨城県霞ヶ浦、千葉県手賀沼、東京都奥多摩湖、長野県諏訪湖、島根県浮布池、城北池、兵庫県平荘湖、香川県三谷三郎池、福岡県昭和池 |
| 47 | Nodularia spumigena | 沖永良部島内城・国頭、島根県隠岐島 |
| 48 | Oscillatoria kawamurae | 琵琶湖南沼 |
| 49 | Planktothrix agardhii | 北半球の温帯の湖沼に広く分布、茨城県霞ヶ浦 |
| 50 | Planktothrix isothrix | 茨城県竜ヶ崎市の中沼、福井県三方湖 |
| 51 | Planktothriciodes raciborskii | 茨城県霞ヶ浦、千葉県手賀沼、滋賀県琵琶湖 |
| 52 | Raphidiopsis curvata | 茨城県霞ヶ浦 |
| 53 | Raphidiopsis mediterranea f. major | 茨城県霞ヶ浦、福井県三方湖 |
| 54 | Trichodesmium iwanoffianum | 北海道根室市の上水源オンネ沼、阿寒湖、シラルトロ湖 |
| 55 | Trichodesmium lacustre | 山梨県河口湖 |
| 56 | Umezakia natans | 福井県三方湖 |
| 57 | Woronichinia naegeliana | 北海道網走湖、リヤウシ湖、釧路市春採湖、東京都国分寺、山梨県富士五湖、福井県三方湖、島根県益田市蟠竜湖 |